山东十一选五骗局:Lnc RNA測序

山东十一选五开奖历达 www.vydji.icu 長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, LncRNA)是近年來引起廣泛關注的一種具有獨特的調控功能的非編碼RNA。LncRNA的長度在200nt以上,不編碼蛋白,物種間保守性較差,有的序列結構與mRNA相似(含有polyA尾,存在可變剪切),有的則無這些特征。目前的研究對LncRNA的產生和功能機制尚未有明確的認識,但已有多種具有重要生物功能(如癌癥發生、X染色體沉默以及與其他調控因子作用構成復雜調控網絡等)的LncRNA被發現。
基迪奧生物使用高通量測序的方法,可以在樣品totalRNA中大量、快速的篩選lncRNA,并對其進行注釋與功能預測。


應用領域
新lncRNA找尋與預測
疾病研究
調控網絡研究

技術路線


 


 
分析內容
1. 標準信息分析
  a)   測序數據評估;數據比對統計,測序飽和度分析,測序隨機性的統計分析,Reads在參考基因上的分布分析
  b)   已知 lnc RNA的識別與注釋
  c)   Novel LncRNA的轉錄本重構與預測
  d)   Lnc RNA 家族分析
  e)   Lnc RNA 表達量的統計

2. 高級信息分析
  a)   lnc RNA 位置分類(Intergentic lncRNA,Intronic lncRNA,Cis-antisense lncRNA)
  b)   候選lnc RNA的保守性分析
  c)   貫穿分析(需同一樣品的不同水平數據,如跟sRNA測序結果關聯??剎慰糾iRNA-TF-gene network分析方案, 或者miRNA-LncRNA關聯分析)
  d)   候選基因分析(某種表達模式基因或者非編碼基因,或者轉錄因子,需指定)
  e)   定制圖表(可按老師提供的參考文獻或者要求制作)
  f)    定制個性化分析(老師提供方案或者參考文獻)


樣品要求
樣品類型:(人、鼠、恒河猴)除去核糖體后(方法1)或再除去含poly-A尾后(方法2)的總RNA(已去除蛋白與DNA)
樣品需求:
A類:總RNA≥10 μg(濃度≥300 ng/μl,純度:OD260/280 =1.8~2.2;OD260/230 ≥2.0;RIN ≥ 7.0,28S:18S ≥1.0)
B類:總RNA為5~10 μg(濃度≥300 ng/μl,純度:OD260/280 =1.8~2.2;OD260/230 ≥2.0;RIN ≥ 7.0,28S:18S ≥1.0)

項目運轉周期
標準流程的運轉周期為45個工作日

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