山东十一选五遗漏和值走势图:基迪奧最新引進10x Genomics Chromium系統

2018/04/13
分享到:
基迪奧生物最新引進擁有的10x Genomics Chromium系統,是目前單細胞轉錄組研究領域通量最高,定量最準的系統。

山东十一选五开奖历达 www.vydji.icu 顯微鏡和染色技術的發展,讓科研工作者看到了細胞和細胞器;X射線衍射法等結構分析技術的進步,推動了DNA分子雙螺旋結構的提出;核酸測序技術的發明,促使生命科學進入全新的基因組時代。

新技術手段的出現,讓科研工作者看到了不一樣的世界。而10x Genomics, 則讓轉錄組研究跨步進入單細胞時代。

基迪奧生物最新引進擁有的10x Genomics Chromium系統,是目前單細胞轉錄組研究領域通量最高,定量最準的系統。


技術原理
10x Genomics單細胞轉錄組測序(single cell RNA-seq, scRNA-seq),能夠以高通量和單分子分辨率研究單個細胞表達譜,揭示復雜細胞群體的異質性,避免單個細胞的基因表達信號被群體的平均化所掩蓋。


圖1 10x Genomics的技術原理

基迪奧生物擁有的10x Genomics Chromium™系統,是目前單細胞轉錄組研究領域通量最高,定量最準的系統。其核心技術是微流體“雙十字”交叉系統形成的GEMs(Gel Bead-In-Emulsions),即油滴包裹的含有獨特Barcode標記信息的凝膠珠與細胞、酶的混合物。GEMs流到儲液器中并被收集,凝膠珠溶解釋放Barcode序列,對樣本進行標記。將所有GEMs的產物混合,構建標準測序文庫。該技術有以下優點:


圖2 10x Genomics技術的優勢

技術應用


圖3 10x Genomics單細胞轉錄組測序的應用領域

10x Genomics單細胞轉錄組測序主要應用于細胞群體研究,可進行單細胞轉錄組定量、細胞亞群體分類(圖 4)、不同亞群細胞差異表達基因篩?。ū曇腔蟶稈?,圖5)、差異表達基因功能分析以及其他高級定制化分析。

分析內容
1、單細胞轉錄組定量

2、細胞亞群體分類

3、不同亞群細胞差異表達基因篩?。ū曇腔蟶稈。?br />
4、差異表達基因功能分析(GO功能分析、KEGG功能分析、轉錄因子注釋)

5、其他高級定制化分析

其中差異表達基因功能分析主要包括差異表達基因GO功能分析、KEGG功能分析和轉錄因子注釋等。


圖4 細胞亞群鑒定


圖5 各亞群標記基因篩選

案例解讀
下面以一篇NC文章中免疫細胞群體的亞型檢測為例,看下10xGenomics單細胞轉錄組測序的應用。

收集健康人donnor A外周血單核細胞(PBMCs),進行單細胞轉錄組測序分析(scRNA-seq)共獲得約68,000個細胞,平均每個細胞獲得20,000 reads,基因中位數和UMI中位數分別為525個和1,000個(圖6 a)。


圖 6 PBMCs不同亞群分類

聚類分析結果確定了10個不同的細胞亞群,細胞比例最低的亞群8只占0.3%(圖6 b)。通過不同亞群間基因的差異表達確定每個亞群的特異性表達基因,巨核細胞標記物PF4在亞群8中特異性高表達,表明亞群8是一類巨核細胞(圖6 c)。

對donnor A PBMCs進行細胞分選,分別對10個亞群進行scRNA-seq用來構建參考轉錄組表達譜,根據參考表達譜將68,000個PBMCs 進行分類(圖6d),分類結果在很大程度上與之前基于特異表達基因的分類結果一致。

Tips:
對單細胞轉錄組測序感興趣的老師和同學可留言咨詢,基迪奧生物有豐富的項目經驗,提供專業的解決方案和一對一的個性化分析服務,技術團隊會攜帶儀器上門服務!

參考文獻
[1] Zheng GX Y, Terry J M, Belgrader P, et al. Massively parallel digital transcriptionalprofiling of single cells[J]. Nature communications, 2017, 8: 14049.

更多的公司動態,可繼續關注我們網站,同時關注基迪奧微信~掃一掃添加基迪奧好友~隨時隨地關注行業動態!

北京塞车计划 六人通比牛牛程序 双色球走势图表 二人麻将下载不联网下载 一分赛车微信计划群 赌博21点玩法介绍 广东11选5任一稳赚技巧 注册就送彩金真实网站 腾讯分分彩免费计划软件手机版 北京塞车计划 大乐透电子投注单怎么用 pk10技巧高手赚钱方法如下 棋牌代理加盟 2019中日女篮决赛 重时时彩现场开奖号码 北京pk赛车两期在线计划