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中山大學生命科學學院項目

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(一)各樣品測序所得reads的成分分析

如圖所示。

A圖表示10個樣品的reads長度分布。

B圖表示10個樣品總reads的注釋結果在長度上的分布。

C圖:左圖為10各樣品的總reads的注釋結果統計,右圖為唯一比對的reads的注釋結果統計。

(二)各樣品miRNA組的表達量及功能分析

(三)差異表達的miRNA在樣品間的分布統計

(四)miRNA Target Genes的KO分析

分析結果:圖A是全部樣品的miRNA靶基因的KEGG顯著性富集結果,圖B為三個階段里的KEGG顯著性富集結果。從圖中可以得到miRNA疑似調控的基因在骨骼肌生長的不同階段中主要參與了那些功能。

(五)差異表達的miRNA趨勢分析

分析結果:使用STEM軟件對差異表達的miRNA進行了趨勢分析:

A表示在骨骼肌纖維組裝過程(35dpc~77dpc)共4個樣品中差異表達的miRNA聚類,有3個趨勢顯著;

B表示在骨骼肌纖維成熟過程(77dpc~180dpn)共6個樣品中差異表達的miRNA聚類,有2個趨勢顯著。

(六)候選肌原性miRNAs 表達模式聚類

分析結果:與肌纖維相關miRNAs有相同的表達模式的差異表達miRNAs被找出并聚類為6類。該圖展示了各類共25個miRNA在10個樣品中的均一化表達量。

(七)qPCR驗證

分析結果:對10個樣品大量表達的隨機9個miRNA的表達量進行qPCR驗證,圖中只列出了2個miRNA作為說明。

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